AccuNext ATAC DNA 建库试剂盒(Illumina)

产品货号:AG12566 / AG12567

¥1,200¥3,000

产品描述

本产品是针对 Illumina 高通量测序平台研发的用于 ATAC-seq 文库构建试剂盒,适用于 103~10个细胞起始量的样本建库。ATAC-seq(Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)是一种通过转座酶介导的高通量测序技术,可快速检测全基因组范围内的染色质开放区域;它能揭示染色质可及性与基因表达调控的关联,为表观遗传研究提供关键线索;适用于染色体开放性图谱绘制、胚胎发育、疾病潜在标志物的预测、肿瘤发生等表观遗传学研究。
本产品使用含有部分 illumina 测序接头的 Tn5 转座体,结合染色质开放区域,对裸露 DNA 进行切割的同时加上测序接头,经 PCR 扩增后可获得测序文库,具有细胞起始范围广、实验周期短、信噪比高、应用范围广等优势。
本产品的反应体系经过了精心优化,实验中所有试剂请使用本产品中提供的,不建议改变任何反应组分或用其他的等效产品替换本产品中组分,以免获得不好的实验结果。如需替换,请先进行验证。

 

产品优势

1. 适用于 illumina 测序平台:整合了 Index 和 illumina 接头,构建的 DNA 文库可直接进行 NGS 测序。
2. 高通量:ATAC-seq 能够在短时间内分析大量样本,适合大规模基因组研究。
3. 低细胞需求:与传统方法相比,ATAC-seq 对细胞数量的需求较低,可从低至 1000 个细胞进行建库。
4. 细胞投入量适用范围广:适用于 103~105 个细胞起始量的样本建库。
5. 高重复性:实验结果具有较高的重复性和一致性。
6. 信噪比高:TSS 富集良好且信噪比高。

 

产品组成

Package 3-1组分如下(-80℃ 保存):

组分 AG12566 AG12567
AccuNext Tn5 Transposome 16 μl 50 μl

Package 3-2组分如下(4℃ 保存):

组分 AG12566 AG12567
DNA Clean Beads 950 μl 2.9 ml
Stop Buffer 80 μl 240 μl

Package 3-3组分如下(-20℃ 保存):

组分 AG12566 AG12567
Lysis Buffer 200 μl 600 μl
Wash Buffer Ⅰ 1 ml X 2 pcs 1.5 ml X 4 pcs
Wash Buffer Ⅱ 1.6 ml 1.6 ml X 3 pcs
Tn5 Reaction Buffer 200 μl 600 μl
1% Digitionin 4 μl 12 μl
AccuNext PCR Mix Ⅱ 80 μl 240 μl
Proteinase K (20 mg / ml ) 4 μl 12 μl
Nuclease free water 1 ml 1 ml

注意:AccuNext 转座体建库适配接头引物(Illumina)(Code No. AG12532 / AG12533 / AG12534)为实验必须试剂,但本产品中未配置,需要单独购买。AccuNext 转座体建库适配接头引物(Illumina)的信息见附录1。

 

保存与运输
保存温度:Package 3-1 -80℃ 保存
Package 3-2 4℃ 保存(避免冻结)
Package 3-3 -20℃ 保存
运输温度:Package 3-1 干冰运输
Package 3-2 冰袋保存
Package 3-3 干冰运输或 -20℃ 冰袋运输
实验示例

1、使用本产品对 GM12878 Cells 进行文库构建,细胞数量为 100000(循环数13)、50000(循环数13)、1000(循环数19)。对文库进行琼脂糖凝胶电泳检测及 Agilent 2100 Bioanalyzer 检测,电泳结果如下:

Agilent 2100 Bioanalyzer 检测结果如下:


图2. 不同细胞量Agilent 2100 Bioanalyzer文库长度检测

上图是 100000 Cells、50000 Cells、1000 Cells 的文库分布图,可看到呈现明显的核小体分布,第一个峰分布在 170~200 bp 左右,为核小体Free 模型;后面出现的的第二个峰为一个核小体模型;第三个峰为两个核小体模型。