本产品是针对 Illumina 高通量测序平台研发的用于 ATAC-seq 文库构建试剂盒,适用于 103~105 个细胞起始量的样本建库。ATAC-seq(Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)是一种通过转座酶介导的高通量测序技术,可快速检测全基因组范围内的染色质开放区域;它能揭示染色质可及性与基因表达调控的关联,为表观遗传研究提供关键线索;适用于染色体开放性图谱绘制、胚胎发育、疾病潜在标志物的预测、肿瘤发生等表观遗传学研究。
本产品使用含有部分 illumina 测序接头的 Tn5 转座体,结合染色质开放区域,对裸露 DNA 进行切割的同时加上测序接头,经 PCR 扩增后可获得测序文库,具有细胞起始范围广、实验周期短、信噪比高、应用范围广等优势。
本产品的反应体系经过了精心优化,实验中所有试剂请使用本产品中提供的,不建议改变任何反应组分或用其他的等效产品替换本产品中组分,以免获得不好的实验结果。如需替换,请先进行验证。
1. 适用于 illumina 测序平台:整合了 Index 和 illumina 接头,构建的 DNA 文库可直接进行 NGS 测序。
2. 高通量:ATAC-seq 能够在短时间内分析大量样本,适合大规模基因组研究。
3. 低细胞需求:与传统方法相比,ATAC-seq 对细胞数量的需求较低,可从低至 1000 个细胞进行建库。
4. 细胞投入量适用范围广:适用于 103~105 个细胞起始量的样本建库。
5. 高重复性:实验结果具有较高的重复性和一致性。
6. 信噪比高:TSS 富集良好且信噪比高。
Package 3-1组分如下(-80℃ 保存):
组分 | AG12566 | AG12567 |
AccuNext Tn5 Transposome | 16 μl | 50 μl |
Package 3-2组分如下(4℃ 保存):
组分 | AG12566 | AG12567 |
DNA Clean Beads | 950 μl | 2.9 ml |
Stop Buffer | 80 μl | 240 μl |
Package 3-3组分如下(-20℃ 保存):
组分 | AG12566 | AG12567 |
Lysis Buffer | 200 μl | 600 μl |
Wash Buffer Ⅰ | 1 ml X 2 pcs | 1.5 ml X 4 pcs |
Wash Buffer Ⅱ | 1.6 ml | 1.6 ml X 3 pcs |
Tn5 Reaction Buffer | 200 μl | 600 μl |
1% Digitionin | 4 μl | 12 μl |
AccuNext PCR Mix Ⅱ | 80 μl | 240 μl |
Proteinase K (20 mg / ml ) | 4 μl | 12 μl |
Nuclease free water | 1 ml | 1 ml |
注意:AccuNext 转座体建库适配接头引物(Illumina)(Code No. AG12532 / AG12533 / AG12534)为实验必须试剂,但本产品中未配置,需要单独购买。AccuNext 转座体建库适配接头引物(Illumina)的信息见附录1。
Package 3-2 4℃ 保存(避免冻结)
Package 3-3 -20℃ 保存
运输温度:Package 3-1 干冰运输
Package 3-2 冰袋保存
Package 3-3 干冰运输或 -20℃ 冰袋运输