AccuNext 链特异性单细胞 / 微量 RNA 建库试剂盒 III(Illumina)

产品货号:AG12595 / AG12596

价格范围:¥8,000 至 ¥24,000

产品描述
本产品是针对 illumina 高通量测序平台设计的链特异性 RNA 测序文库构建试剂 盒,可从 1~100 个细胞或 10 pg ~ 10 ng 的 RNA 样本进行 RNA 文库构建,包含 DNA 消化、RNA 片段化、逆转录 ( RT ) 、PCR 文库扩增所需的所有组分。本产品中 gDNA Clean Enzyme 可有效去除样本中残留的基因组 DNA,可根据样本中是否含基 因组 DNA 残留选择是否添加 gDNA Clean Enzyme,本产品通过加热使 RNA 片段 化,然后用带通用接头序列的 3′-N6 Primer 进行反转录,反转后在 cDNA 末端加上特 定接头;搭配带有 illumina 测序接头的引物进行 PCR 扩增【例如,AccuNext CDI 接 头引物(Illumina,适用于 RNA 文库)(Code No. AG12505、AG12506、 AG12507)】,随后根据需要进行核糖体 RNA 去除,再使用通用引物进行二轮扩 增,纯化完成即可获得适用于 illumina 测序平台的测序文库。 本产品操作简单,反转与接头连接一步完成,适用于低投入量和低质量的 RNA 进 行建库,同时本产品保留了 RNA 链的方向性,可获得 RNA 链特异性的测序数据。 本产品的反应体系经过了精心优化,请使用本产品中提供的试剂进行 RNA 片段化、 逆转录和 PCR 文库扩增实验,不建议改变任何反应组分的用量及浓度或用其他的等效 产品替换本产品中组分,以免获得不好的结果。如需替换,请先进行验证。 本产品中不包含 rRNA 去除模块,可根据需要选择合适的 rRNA 去除试剂。
产品优势
1. 适用于 illumina 测序平台:整合了 Index 和 illumina 接头,构建的 RNA 文库可直 接进行 NGS 测序。
2. 灵敏度高:可从单细胞或 10 pg Total RNA 进行 RNA 文库构建。
3. 用途广泛:适用于 RIN 值 2 ~ 10 的 RNA 样本,同时兼容降解样本(如 FFPE 样 本)及有基因组 DNA 残留样本。
4. 操作简单:无需进行传统的末端修复、接头连接等繁琐的步骤,即可获得 RNA 测 序文库。
5. 能准确识别 RNA 链特异性:Read 1 读取的是原始 RNA 的反义链序列,Read 2 读取的是原始 RNA 的正义链序列。
产品组成

Package 2-1 组分如下(-80℃ 保存):

组分 AG12595 AG12596
5 ‘- Adapter Primer Mix II 54 μl 216 μl
Control Total RNA(1 μg /μl)*1 5 μl 5 μl

*1:Control Total RNA 为 293T Cell Total RNA。

Package 2-2 组分如下(-20℃ 保存):

组分 AG12595 AG12596
RNase Inhibitor ( 40 U/μl ) 18 μl 72 μl
5X First-Strand Buffer II 48 μl 192 μl
gDNA Clean Enzyme 12 μl 48 μl
3′-N6 Primer 12 μl 48 μl
AccuNext RTL Enzyme Mix II 24 μl 96 μl
AccuNext DNA Polymerase (1 U/μl ) 36 μl 144 μl
2X AccuNext PCR Buffer 900 μl 900 μl X 4 pcs
AccuNext PCR Primer Mix 24 μl 96 μl
Nuclease free water 1 ml 1 ml X 3 pcs

注意:AccuNext CDI 接头引物(Illumina,适用于 RNA 文库) (Code No. AG12505、 AG12506、AG12507)为实验必须试剂,但本产品中未配置,需要单独购买。AccuNext CDI 接头引物(Illumina,适用于 RNA 文库)的信息见附录 A 和 B。

保存与运输
保存温度:
Package 2-1   -80℃ 保存
Package 2-2   -20℃ 保存
运输温度:
Package 2-1 干冰运输(避免反复冻融。)
Package 2-2 干冰运输或-20℃冰袋运输
示例一

使用本产品对 Control Total RNA(100 pg)和 293T Cell(100 Cell)进行文库 构建,100 pg RNA 的 PCR2 的循环数为 14 个,100 Cell 的 PCR2 的循环数 为 14 个。结果如下所示:图 3-A 和图 3-B 显示了 100 pg RNA 和 100 Cell 扩增后的文库产物,分布均匀,片段大小分布于 200 ~ 1000 bp;图 3-C 显示 阴性对照(不添加模板)无产物扩增。

图 Agilent 2100 生物分析仪检测结果

示例二

用本产品分别对 1 μg Control Total RNA、100pg Control Total RNA 及 100 个 293T Cell 进行文库构建,使用 Illumina NovaSeq 6000 系统 c 测序,数据如下:

 

 

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