本产品是针对 Illumina 高通量测序平台研发的链特异性 RNA 文库构建试剂盒,可对 100 pg ~ 100 ng 的 RNA 样本进行 RNA 文库构建,包含 RNA 片段化、逆转录 ( RT ) 和 PCR 文库扩增所需的所有组分。本产品通过加热使 RNA 片段化,然后以带接头序列的 3′-N6 Primer 进行反转录,依靠反转录酶的模板转换活性 (Template-switching),在 RNA 5′ 端添加一段接头序列,产生两端带有接头序列的 cDNA;搭配 AccuNext CDI 接头引物(Illumina,适用于RNA文库)(Code No. AG12505、AG12506、AG12507)进行 PCR 扩增即可获得适用于 Illumina 测序平台的测序文库。
本产品操作简单,无需进行传统的末端修复、接头连接等繁琐的步骤,即可获得 RNA 测序文库;优化的反应体系,提高了文库转化效率,能兼容不同的模板量,测序获得的数据均一性高,覆盖度完整;同时,模板转换反应的方向性保留了 RNA 的链方向性,可获得 RNA 链特异性的测序数据。
由于 Total RNA 中 rRNA 占比近 90%,为了测序时获得更多有效的数据量及降低测序成本,建议去除 rRNA 后再进行 RNA 文库构建,以减少测序中 rRNA 的数据占比,获得更多有效的数据。
本产品的反应体系经过了精心优化,请使用本产品中提供的试剂进行 RNA 片段化、逆转录和 PCR 文库扩增实验,建议不改变任何反应组分的用量及浓度,或用其他的等效产品替换本产品中组分,以免获得不好的结果。如需替换,请先进行验证。
2. 模板适用范围广:可对 100 pg ~ 100 ng RNA 进行 RNA 文库构建;可兼容真核及原核生物 RNA 样本;降解的 RNA 也可以成功建库,兼容 RIN 值 2 ~ 10 的 RNA 样本。
3. 操作简单:无需进行传统的末端修复、接头连接等繁琐的步骤,即可获得 RNA 测序文库。
4. 能准确识别 RNA 链特异性:Read 1 读取的是原始 RNA 的反义链序列,Read 2 读取的是原始 RNA 的正义链序列;
5. 产品性能稳定:实验操作可重复。
Package 2-1 组分如下(-80℃ 保存):
组分 | AG12503 | AG12504 |
Control Total RNA*(1 μg / μl) | 20 μl | 20 μl |
5′-Adapter Primer Mix | 54 μl | 216 μl |
*:Control Total RNA 为 Mouse Liver Total RNA。
Package 2-2 组分如下(-20℃ 保存):
组分 | AG12503 | AG12504 |
RNase Inhibitor(40 U / μl) | 6 μl | 24 μl |
3′-N6 Primer | 12 μl | 48 μl |
5X First-Strand Buffer | 48 μl | 192 μl |
AccuNext Reverse Transcriptase(100 U / μl) | 24 μl | 96 μl |
AccuNext DNA Polymerase(1 U / μl) | 12 μl | 48 μl |
2X AccuNext PCR Buffer | 300 μl | 1.2 ml |
Nuclease free water | 1 ml | 1 ml X 4 pcs |
注意:AccuNext CDI 接头引物(Illumina,适用于RNA文库)(Code No. AG12505、AG12506、AG12507)为实验必须试剂,但本产品中未配置,需要单独购买。AccuNext CDI 接头引物(Illumina,适用于RNA文库)的信息见附录A和B。
运输温度:Package 2-1 干冰运输 Package 2-2 -20℃冰袋运输或干冰运输