示例一
采用本试剂盒对西红柿、水稻叶片样本直接进行 PCR 扩增,可获得较好的扩增效果。
*:西红柿 0.6 kb、1.6 kb 延伸速度 10 sec / kb;3 kb延伸速度 30 sec / kb;
*:水稻叶片 1.1 kb、3 kb、5 kb 延伸速度 10 sec / kb;7.5 kb、12 kb 延伸速度 20 sec / kb。
电泳结果如下图所示:
示例二
将菠菜叶片、水稻叶片、土豆块茎等用蛋白酶 K 法简单裂解 【使用本公司产品 Lysis Buffer for PCR(Code No. AG12306)】,并以裂解产物为模板,采用本试剂盒扩增不同的 DNA 片段,都能获得很好的扩增效果。
电泳结果如下图所示:
实验例表
模板类型 |
扩增速度 |
片段大小 |
序列 GC 含量 |
简单裂解 |
直接 PCR |
裂解后的模板量*2 |
能否扩增*1 |
直接模板量*1 |
能否扩增*1 |
水稻叶片 |
10 sec / kb |
1 kb |
45.6% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
水稻叶片 |
10 sec / kb |
3 kb |
41.5% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
水稻叶片 |
15 sec / kb |
5 kb |
40.5% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
水稻叶片 |
20 sec / kb |
7.5 kb |
46.8% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
水稻叶片 |
20 sec / kb |
12 kb |
44.6% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
土豆块茎 |
10 sec / kb |
1.3 kb |
39.5% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 块茎简单裂解) |
√ |
5-10 mm3 |
√ |
土豆块茎 |
15 sec / kb |
2 kb |
39.6% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 块茎简单裂解) |
√ |
5-10 mm3 |
√ |
土豆块茎 |
15 sec / kb |
2.9 kb |
38.2% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 块茎简单裂解) |
√ |
5-10 mm3 |
√ |
土豆块茎 |
15 sec / kb |
5.8 kb |
35.4% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 块茎简单裂解) |
√ |
5-10 mm3 |
√ |
土豆块茎 |
30 sec / kb |
10 kb |
38.0% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 块茎简单裂解) |
√ |
5-10 mm3 |
√ |
菠菜叶片 |
10 sec / kb |
0.7 kb |
38.9% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
菠菜叶片 |
10 sec / kb |
1 kb |
42.3% |
2-4 μl裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
菠菜叶片 |
15 sec / kb |
5 kb |
33.4% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
菠菜叶片 |
15 sec / kb |
10 kb |
35.1% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
4-10 mm2 |
√ |
西红柿果肉 |
10 sec / kb |
0.5 kb |
28.2% |
2-4 μl 裂解液
(2 μl 果肉简单裂解) |
√ |
2 μl |
√ |
西红柿果肉 |
10 sec / kb |
1.6 kb |
32.2% |
2-4 μl 裂解液
(2 μl 果肉简单裂解) |
√ |
2 μl |
√ |
西红柿果肉 |
10 sec / kb |
1.9 kb |
36.0% |
2-4 μl 裂解液
(2 μl 果肉简单裂解) |
√ |
× |
× |
西红柿果肉 |
15 sec / kb |
3 kb |
37.4% |
2-4 μl 裂解液
(2 μl 果肉简单裂解) |
√ |
2 μl |
√ |
西红柿果肉 |
20 sec / kb |
4.4 kb |
37.6% |
2-4 μl 裂解液
(2 μl 果肉简单裂解) |
√ |
2 μl |
√ |
西红柿果肉 |
20 sec / kb |
5 kb |
38.2% |
2-4 μl 裂解液
(2 μl 果肉简单裂解) |
√ |
2 μl |
√ |
西红柿果肉 |
30 sec / kb |
5.8 kb |
37.6% |
2-4 μl 裂解液
(2 μl 果肉简单裂解) |
√ |
× |
× |
拟南芥叶片 |
24 sec / kb |
2.2 kb |
35.2% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
/ |
/ |
拟南芥叶片 |
24 sec / kb |
3 kb |
41.0% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
/ |
/ |
拟南芥叶片 |
24 sec / kb |
5 kb |
38.0% |
2-4 μl 裂解液
(4-10 mm2 叶片简单裂解) |
√ |
/ |
/ |
玉米粒 |
15 sec / kb |
1 kb |
52.4% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 胚组织简单裂解) |
√ |
× |
× |
玉米粒 |
20 sec / kb |
1.8 kb |
48.0% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 胚组织简单裂解) |
√ |
× |
× |
玉米粒 |
15 sec / kb |
3 kb |
56.0% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 胚组织简单裂解) |
√ |
× |
× |
玉米粒 |
15 sec / kb |
4.4 kb |
55.0% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 胚组织简单裂解) |
√ |
× |
× |
玉米粒 |
15 sec / kb |
5.7 kb |
58.4% |
2-4 μl 裂解液
(5-10 mm3 胚组织简单裂解) |
√ |
× |
× |
*1:√表示能够扩增,× 表示未扩增出目的条带,/ 表示未进行扩增。
*2:简单裂解使用本公司制品 Lysis Buffer for PCR(Code. AG12306)。