AccuNext 单细胞 / 微量 cDNA 合成及扩增试剂 II

产品货号:AG12575 / AG12576

价格范围:¥6,000 至 ¥18,000

产品描述
本产品是在 AccuNext 单细胞/微量 cDNA 合成及扩增试剂盒基础上进行优化,其检测灵敏度大幅提升,本产品使用新型耐热、延伸能力强的Evo Super M-MLV 反转录酶并搭配精心优化的扩增体系,避免了 PCR 扩增的偏好性,整个文库产量更高及基因 (包括低表达基因)检出量更高。同时本产品的组分进行预混,优化操作步骤,使实验操作更简便。
本产品适用于无细胞壁的真核生物细胞(如哺乳动物细胞)或带有 Poly(A)尾的 RNA 全长 cDNA 合成与扩增。本产品包含进行细胞裂解、反转录 ( RT ) 和 PCR 扩增所需的所有组分,既可直接以 1 ~ 1000 个细胞为模板,也可以 10 pg ~ 100 ng 总 RNA 为模板,使用带特定接头的Oligo (dT) Primer 进行反转录;利用反转录酶的末端转移酶活性,在反转录酶到达 mRNA 5′ 端时,在 cDNA 的 3′  端引入几个不依赖于模板的碱基,通过 5′ Template Switching Oligo ( TSO ) 继续合成带有特定接头的 cDNA;利用添加在第一链 cDNA 两端接头序列进行后续的 PCR 扩增,确保了最终的 cDNA 文库包含 mRNA 的 5′ 末端,保持 mRNA 转录本的原始表达信息,避免 3′  端的偏好性。
通过对全长 cDNA 文库进行 NGS 测序,可进行基因表达差异分析、可变剪接、融合基因等遗传调控信息分析。本产品能兼容 1 ~ 12 μl 的样本体积,可获得 2 ~ 40 ng 的 cDNA 扩增产物。
本产品的反应体系经过了精心优化,请使用本产品包含的试剂进行细胞裂解、逆转录 ( RT ) 和 PCR 扩增实验,不建议改变任何反应组分的用量及浓度或用其他的等效产品替换本产品中组分,以免获得不好的结果。如需替换,请先进行验证。
产品优势
1. 超高灵敏度:可以单细胞为模板或以 10 pg RNA 为模板进行高效扩增。
2. 使用新型耐热、延伸能力强的 Evo Super M-MLV 反转录酶,搭配精心优化的扩增体系,避免了 PCR 扩增的偏好性,同时整个文库产量高及基因(包括低表达基因)检出量高。
3. 将组分进行预混,操作方便,缩短了建库时间。
4. 通过双端引物扩增全长 cDNA,可获得全转录组信息,避免了 5′ 端和 3′ 端偏好性。
产品组成

Package 2-1 组分如下(-80℃ 保存):

组分 AG12575 AG12576
Control Total RNA*1(1 μg / μl) 5 μl 5 μl
5′ Template Switching Oligo 12 μl 48 μl

*1:Control Total RNA为 293T Cell Total RNA。

Package 2-2 组分如下(-20℃ 保存):

组分 AG12575 AG12576
7X Cell Lysis Buffer*2 24 μl 96 μl
4X First-Strand Synthesis Mix 60 μl 240 μl
2X AccuNext PCR Mix I 300 μl 1.2 ml
PCR Primers 12 μl 48 μl
Nuclease free water 1 ml 1 ml

*2:包含3′ Oligo (dT) Primer。

保存与运输
保存温度:
Package 2-1   -80℃ 保存
Package 2-2   -20℃ 保存
运输温度:
Package 2-1 干冰运输(避免反复冻融。)
Package 2-2 干冰运输或-20℃冰袋运输
示例一

采用本产品进行 Control Total RNA 全长 cDNA 扩增,RNA 模板添加量为 10 pg,PCR 扩增循环数为 18。结果如下:图3. A显示了 cDNA 合成和扩增后的纯化产物,分布均匀。图3. B 显示无模板的阴性对照中没有产物。

图3. Agilent 2100 生物分析仪检测结果

示例二

用本产品分别对 1 – 1000 个 293T Cell 及 10 pg – 100 ng 293T Cell RNA 进行反转录及 PCR 扩增,然后以 PCR 产物构建 DNA 文库,使用Illumina NovaSeq 6000 系统测序,数据如下:

表2. 1-1000 个 293T Cell 主要 mRNA-Seq 数据

表3. 10 pg ~ 100 ng 的 293T Cell total RNA 主要 mRNA-Seq 数据

示例三

以 1 ~ 1000 个293T Cell 为模板,用本产品进行反转录及 PCR 扩增,然后以 PCR 产物构建 DNA 文库,使用 Illumina NovaSeq 6000 系统测序,做两次重复实验,两次结果的基因表达相关性很高,实验重复性好(图4:A为1 cells、B为10 cells、C为100 cells、D为1000 cell)。

图4. 基因表达重复性分析